IPB
Форуму требуются модераторы из числа студентов или работающих в МГУ! Пишите на wzadm yandex.ru !

Ваш энциклопедический текст удалили из Википедии? Сохраните его в Викизнании или смежном проекте!

Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )

→ 

Добавить в закладки - CTRL-D

3 страниц V  < 1 2 3  
Reply to this topicStart new topic
Калиевые пруды и натриевые океаны. Физические свойства протоклеток и происхождение внутриклеточной среды, Почему молчат физики?
Vladimir Matveev
сообщение 20.6.2015, 11:36
Сообщение #41


практически свой
***

Группа: Участники
Сообщений: 38

Предупреждения:
(0%) -----


Цитата
Да. Сделано. Вы оперативно предоставляете мне информацию. Этого достаточно для начала анализа. Начинаем?

Я не физик, но помогу по мере сил.
Несмотря на Вашу решимость, стоит, всё-таки, узнать, что уже сделано до Вас. Для этого можно прочесть вот эту книгу: http://www.bioparadigma.spb.ru/russianling/russianling.htm
Go to the top of the page Вставить ник
+
Какоткин Р. В.
сообщение 20.6.2015, 13:58
Сообщение #42


...
***********

Группа: Элита
Сообщений: 2,148

Предупреждения:
(0%) -----


Цитата
Несмотря на Вашу решимость, стоит, всё-таки, узнать, что уже сделано до Вас. Для этого можно прочесть вот эту книгу: http://www.bioparadigma.spb.ru/russianling/russianling.htm

Вы пытаетесь мне продать книгу? Или ознакомительной версии для меня будет достаточно?
Go to the top of the page Вставить ник
+
Vladimir Matveev
сообщение 20.6.2015, 15:22
Сообщение #43


практически свой
***

Группа: Участники
Сообщений: 38

Предупреждения:
(0%) -----


Цитата
Вы пытаетесь мне продать книгу? Или ознакомительной версии для меня будет достаточно?

Я книг не продаю. Попробуйте начать с ознакомительной версии.
Go to the top of the page Вставить ник
+
Какоткин Р. В.
сообщение 22.7.2015, 18:20
Сообщение #44


...
***********

Группа: Элита
Сообщений: 2,148

Предупреждения:
(0%) -----


Цитата(Vladimir Matveev @ 20.6.2015, 11:36) *
Цитата
Да. Сделано. Вы оперативно предоставляете мне информацию. Этого достаточно для начала анализа. Начинаем?

Я не физик, но помогу по мере сил.
Несмотря на Вашу решимость, стоит, всё-таки, узнать, что уже сделано до Вас. Для этого можно прочесть вот эту книгу: http://www.bioparadigma.spb.ru/russianling/russianling.htm

Прочел книгу.
Цитата
Пока нет фактов, ионные молекулярные насосы остаются не более, чем предположением. Таков суровый приговор научного метода.

Но и нет фактов, опровергающих их существование. И если натрий-калиевый насос (Na+/K+-АТФаза) является лишней сущностью, то как Вы объясните последствия связывающего и ингибирующего действия на последнюю уабаина?
Go to the top of the page Вставить ник
+
Vladimir Matveev
сообщение 23.7.2015, 7:38
Сообщение #45


практически свой
***

Группа: Участники
Сообщений: 38

Предупреждения:
(0%) -----


Цитата
Но и нет фактов, опровергающих их существование. И если натрий-калиевый насос (Na+/K+-АТФаза) является лишней сущностью, то как Вы объясните последствия связывающего и ингибирующего действия на последнюю уабаина?

Вы, очевидно, не прочитали основные главы книги. Уабаин связывается с белками, ответственными за избирательное связывание ионов калия. Это приводит к изменению селективности центров связывания. Ключевое слово к теории Линга это АДСОРБЦИЯ. Адсорбция везде, адсорбция всегда. Адсорбция, а не проницаемость! На этом рисунке показано как изменяется адсорбция калия и натрия в зависимости от их концентрации в среде в присутствии и без уабаина: http://www.bioparadigma.spb.ru/hidden_hist...mages/fig57.gif Сторонники ионного насоса избегают ее комментировать...

Я готов Вам помогать, но перспектива пересказывать здесь всю книгу вряд ли кого вдохновит. (IMG:style_emoticons/default/drinks.gif)
Go to the top of the page Вставить ник
+
Какоткин Р. В.
сообщение 28.7.2015, 17:32
Сообщение #46


...
***********

Группа: Элита
Сообщений: 2,148

Предупреждения:
(0%) -----


Цитата
Предположением я называю существование ионных (и других) насосов, которые поддерживают градиент концентраций, затрачивая на это энергию.

Тем не менее рядом экспериментов подтверждаются как существование молекул, претендующих на роль насосов, так и их взаимодействие с АТФ. Каков вклад этих взаимодействий в концентрационные градиенты - другой вопрос.
Цитата
Я говорю о природе селективности кислотных (в данном случае) групп к катионам: почему данная карбоксильная группа предпочитает связываться с K+, а не с Na+? Какими физическими причинами это можно объяснить?

Физическая причина - энергетическая выгодность связи.
Цитата
Вопрос: как электронная плотность определяет избирательность? Это фундаментальная проблема для физиологии клетки и для физики тоже. Тут не помощь нужна. Нужно решить проблему! Что теоретическая физика может дать в этом плане? Это нетривиальная проблема. В этой проблеме загадка жизни.

В качестве механизма возможно рассмотреть вариант с образованием куперовских пар.
Go to the top of the page Вставить ник
+
Vladimir Matveev
сообщение 29.7.2015, 8:36
Сообщение #47


практически свой
***

Группа: Участники
Сообщений: 38

Предупреждения:
(0%) -----


Цитата
В качестве механизма возможно рассмотреть вариант с образованием куперовских пар.

Это интересно, но вне моей компетенции.
Go to the top of the page Вставить ник
+
Какоткин Р. В.
сообщение 29.7.2015, 11:19
Сообщение #48


...
***********

Группа: Элита
Сообщений: 2,148

Предупреждения:
(0%) -----


При определенных условиях ионы могут образовывать слабосвязанные состояния. При этом может возникнуть энергетическая щель, препятствующая изменению квантового состояния ионов одного вида, что может привести к смене предпочтений - связыванию с ионами другого вида.
Go to the top of the page Вставить ник
+
Vladimir Matveev
сообщение 29.7.2015, 11:21
Сообщение #49


практически свой
***

Группа: Участники
Сообщений: 38

Предупреждения:
(0%) -----


Цитата
При определенных условиях ионы могут образовывать слабосвязанные состояния. При этом может возникнуть энергетическая щель, препятствующая изменению квантового состояния ионов одного вида, что может привести к смене предпочтений - связыванию с ионами другого вида.

Хотелось бы получить ссылки на литературу...
Спасибо.
Go to the top of the page Вставить ник
+
Какоткин Р. В.
сообщение 29.7.2015, 13:13
Сообщение #50


...
***********

Группа: Элита
Сообщений: 2,148

Предупреждения:
(0%) -----


Цитата(Vladimir Matveev @ 29.7.2015, 12:21) *
Цитата
При определенных условиях ионы могут образовывать слабосвязанные состояния. При этом может возникнуть энергетическая щель, препятствующая изменению квантового состояния ионов одного вида, что может привести к смене предпочтений - связыванию с ионами другого вида.

Хотелось бы получить ссылки на литературу...
Спасибо.

Я могу попытаться разъяснить Вам более подробно отдельные детали механизма. Будем рассматривать - будут ссылки. Жду конкретных вопросов.
Go to the top of the page Вставить ник
+
Vladimir Matveev
сообщение 29.7.2015, 13:34
Сообщение #51


практически свой
***

Группа: Участники
Сообщений: 38

Предупреждения:
(0%) -----


Цитата
Будем рассматривать - будут ссылки. Жду конкретных вопросов.

В физиологии клетки один вопрос: почему белки способны селективно связывать калий В ПРИСУТСТВИИ натрия:
http://www.bioparadigma.spb.ru/hidden_hist...mages/fig15.gif
http://www.bioparadigma.spb.ru/hidden_hist...mages/fig16.gif
http://www.bioparadigma.spb.ru/hidden_hist...mages/fig18.jpg

Но поскольку белки могут оказаться слишком сложной системой для физики, предлагаю ознакомиться с этой статьей:
https://www.researchgate.net/profile/Murray...51a6fea7563.pdf
В ней речь идет о глине, которая тоже обнаруживает способность к селективному связыванию.
Go to the top of the page Вставить ник
+
Какоткин Р. В.
сообщение 29.7.2015, 15:49
Сообщение #52


...
***********

Группа: Элита
Сообщений: 2,148

Предупреждения:
(0%) -----


Цитата
В физиологии клетки один вопрос: почему белки способны селективно связывать калий В ПРИСУТСТВИИ натрия:

Я уже ответил на этот вопрос. Возможно потому, что ионы способны образовывать слабосвязанные состояния, и для связи с такими ионами необходимо эти состояния разрушить.
Цитата
Но поскольку белки могут оказаться слишком сложной системой для физики, предлагаю ознакомиться с этой статьей:

Сложность - не помеха. Мы рассматриваем не варианты смены белковых конформаций, а энергетическую выгодность одних связей относительно других.

Go to the top of the page Вставить ник
+
Vladimir Matveev
сообщение 30.7.2015, 8:00
Сообщение #53


практически свой
***

Группа: Участники
Сообщений: 38

Предупреждения:
(0%) -----


Цитата
Сложность - не помеха. Мы рассматриваем не варианты смены белковых конформаций, а энергетическую выгодность одних связей относительно других.

В таком случае, имеющийся экспериментальный материал ставит перед физикой общую проблему: как изменение электронной плотности на карбоксильных группах белка определяет их сродство к K+ в одних условиях и к Na+ - в других. Разумеется, фиксированные положительные заряды, да и любые другие функциональные группы, тоже будут вовлечены в этот процесс.
Существенной проблемой теории Линга было отсутствие избирательного связывания ионов изолированными ("неживыми") молекулами белка. Но эта трудность была преодолена Эдельманом, показавшим способность лиофилизированного белкового матрикса мышц, пропитанного нейтральной смолой, избирательно связывать калий в присутствии натрия. Необходимые подробности Вы найдете в этой книге: http://www.bioparadigma.spb.ru/files/Ling-...sis.of.Life.pdf
Статьи Эдельманна здесь: http://www.bioparadigma.spb.ru/edelmann.htm

Линг обращает внимание на особенность фиксированных зарядов: поскольку они находятся на макромолекуле, их подвижность ниже, чем у свободных Na+, K+ и других малых ионов. Отсутствие резких "шараханий" фиксированных анионов увеличивает время жизни пары анион-катион.
Go to the top of the page Вставить ник
+
Какоткин Р. В.
сообщение 21.8.2015, 14:29
Сообщение #54


...
***********

Группа: Элита
Сообщений: 2,148

Предупреждения:
(0%) -----


Цитата(Vladimir Matveev @ 20.6.2015, 7:58) *
Цитата
У Вас есть время, желание и средства на проведение некоторых экспериментов?

Желание есть. Всего остального нет. В биологическом институте физические эксперименты невозможны.

Не знаю, что Вы задумали, но, возможно, кое-что уже сделано (см. рис. 42). Величина c: один из количественных параметров, используемый в теории ассоциации-индукции. Этот показатель характеризует электронную плотность однозарядного атома кислорода в кислородсодержащей кислотной группе. Отражает вариабельность электронной плотности, определяющей константу диссоциаций кислот (pK). Слабые кислоты (с высоким pK) имеют более высокое значение c, сильные кислоты (с низким pK) — более низкую величину c.

Цитата(Vladimir Matveev @ 30.7.2015, 8:00) *
Цитата
Сложность - не помеха. Мы рассматриваем не варианты смены белковых конформаций, а энергетическую выгодность одних связей относительно других.

В таком случае, имеющийся экспериментальный материал ставит перед физикой общую проблему: как изменение электронной плотности на карбоксильных группах белка определяет их сродство к K+ в одних условиях и к Na+ - в других. Разумеется, фиксированные положительные заряды, да и любые другие функциональные группы, тоже будут вовлечены в этот процесс.
Существенной проблемой теории Линга было отсутствие избирательного связывания ионов изолированными ("неживыми") молекулами белка. Но эта трудность была преодолена Эдельманом, показавшим способность лиофилизированного белкового матрикса мышц, пропитанного нейтральной смолой, избирательно связывать калий в присутствии натрия. Необходимые подробности Вы найдете в этой книге: http://www.bioparadigma.spb.ru/files/Ling-...sis.of.Life.pdf
Статьи Эдельманна здесь: http://www.bioparadigma.spb.ru/edelmann.htm

Линг обращает внимание на особенность фиксированных зарядов: поскольку они находятся на макромолекуле, их подвижность ниже, чем у свободных Na+, K+ и других малых ионов. Отсутствие резких "шараханий" фиксированных анионов увеличивает время жизни пары анион-катион.

В Вашем биологическом институте не проводят исследования, связанные с магнитным ядерным резонансом?
Go to the top of the page Вставить ник
+
Vladimir Matveev
сообщение 22.8.2015, 7:02
Сообщение #55


практически свой
***

Группа: Участники
Сообщений: 38

Предупреждения:
(0%) -----


Цитата
В Вашем биологическом институте не проводят исследования, связанные с магнитным ядерным резонансом?

Нет. Увы.

Физиков, интересующихся биологией Вы можете найти здесь: http://www.biophys.ru/congress-2015/coming...ss/sci-programm
Go to the top of the page Вставить ник
+
Какоткин Р. В.
сообщение 22.8.2015, 13:37
Сообщение #56


...
***********

Группа: Элита
Сообщений: 2,148

Предупреждения:
(0%) -----


Зачем мне физики? Мне и так все понятно.
Go to the top of the page Вставить ник
+
Vladimir Matveev
сообщение 21.4.2016, 9:34
Сообщение #57


практически свой
***

Группа: Участники
Сообщений: 38

Предупреждения:
(0%) -----


Основной вопрос науки о происхождении жизни: мембрана или биофаза?
http://www.bioparadigma.spb.ru/files/Matve...siology.Rus.pdf
Go to the top of the page Вставить ник
+

3 страниц V  < 1 2 3
Reply to this topicStart new topic

 

Хостится на базе технических средств проекта Викизнание! Связаться с вебмастером по e-mail: wzadm yandex ru
RSS Текстовая версия Сейчас: 22.02.2020, 13:32
Рейтинг@Mail.ru